Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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