Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms