Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms