Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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