Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms