Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms