Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPP3CAQ08209 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms