Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CHRNEQ04844 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms