Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREMQ03060 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms