Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms