Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms