Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRX1P78414 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms