Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEP78395 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms