Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms