Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms