Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFDNP55196 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFDNP55196 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFDNP55196 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AFDNP55196 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms