Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GEMP55040 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEMP55040 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms