Protein–RNA interactions for Protein: P54756

EPHA5, Ephrin type-A receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA5P54756 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA5P54756 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms