Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA4P51532 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms