Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms