Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms