Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT3P35638 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms