Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms