Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms