Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms