Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL9P32969 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL9P32969 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms