Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms