Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms