Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCND1P24385 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCND1P24385 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCND1P24385 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCND1P24385 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCND1P24385 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCND1P24385 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms