Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms