Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CXCL3P19876 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CXCL3P19876 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CXCL3P19876 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CXCL3P19876 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CXCL3P19876 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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