Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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