Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms