Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms