Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAV1P15498 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms