Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ITGA4P13612 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms