Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL6A2P12110 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms