Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APODP05090 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms