Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms