Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX3O95343 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX3O95343 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX3O95343 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX3O95343 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX3O95343 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms