Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms