Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF749O43361 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms