Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms