Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HOXC11O43248 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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