Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.9 ms