Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0J9YYE9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0J9YYE9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms