Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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