Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms