Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL42Q9P2K6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms