Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRBP1Q9P2E9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms